九阴真经手游武当、少林、峨眉、丐帮、唐门、君子堂、极乐谷、锦衣卫，八大门派齐聚武林谁与争锋，八大门派各自拥有门派武学、内功以及镇派武学等诸多特色，风格迥异的门派服饰可以在游戏中清晰的识别他们。
武 当
门派阵营：正派
门派定位：近战
门派武器：拳/剑
武学特色：持久群攻
门派武学：两仪剑法 | 太极剑法 | 清风剑法
武当拥有门派武学：太极剑法、清风剑法和两仪剑法。太极剑法的伤害虽然不高，却拥有持续战斗的能力，配合轻功的使用，边打边跑，武当往往在消耗战中占据优势。天马行空的气招可以提供气血内力互换，保持武当的血量，另一方面三环套月提供内力回复，使得武当能持续输出伤害。在禁地中，持续回复内力、招架回复内力、气血内力转换使武当派拥有很强持续战斗能力。
少 林
门派阵营：正派
门派定位：近战
门派武器：拳脚/棍棒
武学特色：群体晕眩
门派武学：太祖长拳|达摩棍法|韦陀棍法
少林拥有门派武学：达摩棍法、太祖长拳、韦陀棍法，太祖长拳、达摩棍法是非常的强势，无论副本，单挑，群架少林都是佼佼者，由于少林武学在近身PK方面很强，在拥有相同的操作水平时，在对抗唐门玩家时会稍显吃力。
峨 眉
门派阵营：正派
门派定位：近战/远程
门派武器：掌指/匕首
武学特色：群体疗伤
门派武学：云霞刺|离别刺|金顶绵掌
峨眉在九阴真经端游中拥有伤害吸收以及回复能力，同时又拥有着高爆发的伤害输出，对操作水平会有一定的要求。
丐 帮
门派阵营：正派
门派定位：近战
门派武器：拳脚/棍棒
武学特色：群体伤害
门派武学：灵蛇棒法|哭丧棒法|莲花掌法
丐帮在游戏中是综合能力很强的门派，丐帮内功配合莲花掌法的爆发力不容小觑。
唐 门
门派阵营：中立
门派定位：远程
门派武器：飞镖/匕首
武学特色：毒药暗器
门派武学：迷魂镖|金蛇刺|分光捉影刺
唐门在游戏中是让很多玩家头疼的门派，机动能力强、伤害输出高、即可远攻亦可近战，唐门的迷魂镖，让很多玩家深感头疼，在夺书的时候更是拥有着不错的优势地位。
君子堂
门派阵营：中立
门派定位：中程
门派武器：双剑/乐器
武学特色：音律攻击
门派武学：逍遥腿法|无涯剑法|落英飞花
君子堂的霸体群攻武学让众多玩家印象深刻，同时逍遥腿法在PK上的强势也是不容忽视，在群体PK方面占据着优势地位。
极乐谷
门派阵营：邪派
门派定位：远程
门派武器：刀剑/拳脚
武学特色：阴险毒辣
门派武学：追风刀法|天绝地灭刺|腐骨掌
极乐谷在九阴真经端游中被誉为单挑最强门派，其武学和内功在单挑方面拥有着很强的优势。
锦衣卫
门派阵营：邪派
门派定位：远程
门派武器：刀剑/拳脚
武学特色：阴险毒辣
门派武学：失魂刀法|鹰爪拳|追魂爪
锦衣卫在游戏中拥有着不错的远程控制能力以及单体输出能力，其门派武学追魂抓受到玩家追捧，镇派武学血杀刀法威力惊人。
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